La ganadería mal manejada puede afectar negativamente a los ambientes naturales. No solo produce cambios en la estructura y diversidad de la matriz vegetal, sino que también puede generar compactación y erosión de suelos, alteraciones en los cursos y espejos de agua y pérdida de reclutamiento de renovales. Una sanidad no controlada del ganado, puede difundir patógenos en fauna silvestre. Especies domesticas manejadas inadecuadamente pueden asilvestrarse y quedar fuera de control en el ambiente.